由于许多疑问，中本聪和BTC从未逃脱过阴谋论。也许中本聪不是一个人，而是BTC系统建立背后的组织化身。该组织以更严格的方式化身为中本聪，成立BTC后，他逐渐放弃了这一替代品。看似无组织的比特币系统实际上是控制世界金融系统的最佳工具。关于BTC鼻祖中本聪的猜测很多，我们目前所知道的只是一小部分，真正的中本聪本人或组织就在我们身后。
中本聪从未透露过自己的身份， 他所有的网络记录都是通过PGP加密和Tor网络隐藏的。讨论小组的其他人也不知道他的身份。他甚至故意伪造电子邮件中的一些细节来隐藏身份信息，比如使用未知的技术术语，选择欧洲时间联系，选择固定的英语单词，甚至本聪也可能是日本名字的化名。
根据斯诺登的消息，美国国安局在一般加密标准下有一个可以克服的区域。但中本聪避免了所有的陷阱，并选择了其他加密方法。在FBI多年的搜索中，没有找到与中本聪相关的所有有效线索。
有人猜测，日本京都大学的数学家望月真一是中本聪本人，但这一猜测尚未得到证实。中本聪拥有超越普通人的密码学、计算机、数学和经济学相关知识，而望月真一的知识构成不足以完成像BTC这样庞大的密码加密项目。从BTC的知识结构来看，很少有人能同时拥有这些知识能力。
